Die Seegrotte blieb eine geologische Kuriosität bis zum Zweiten Weltkrieg, als Heinkel die Höhle als geheime Flugzeugfabrik zweckentfremdete und unter den Gewölbedecken zwanzig Meter unter der Erde Teile des Düsenjägers He 162 baute. Nach 1945 legte die österreichische Regierung die Werkstätten trocken, restaurierte den See und öffnete die Anlage 1948 für die Öffentlichkeit. Heute ist sie der größte mit dem Boot befahrbare unterirdische See Europas.
Der Wienerwald, ein bewaldetes Kalksteingebirge, das den westlichen Rand der Hauptstadt umschließt, bietet seit der Römerzeit Schutz für Steinbrüche und Minen. Der hier abgebaute Gips verstärkte jahrhundertelang den Wiener Stuck, und die Tunnel, die den Hang durchzogen, wurden im Sommer zu natürlichen Kühlkammern und im Winter zu Schutzräumen. Die Seegrotte befindet sich in den tiefsten dieser Abbaustätten, wo ständige Versickerung und fast völlige Dunkelheit ein Mikroklima bewahren, das ganzjährig bei etwa neun Grad Celsius liegt. Die Seeoberfläche spiegelt das gewölbte Gestein mit spiegelnder Klarheit wider, und die in den 1950er Jahren installierte elektrische Beleuchtung wirft bernsteinfarbene Schimmer über das Wasser und enthüllt die Schichtungen aus weißem Gips und grauem Mergel.
Geführte Touren zum Wiener Unterwassersee finden alle dreißig Minuten statt und dauern fünfundvierzig Minuten. Besucher steigen eine befestigte Rampe zu einem Holzsteg hinab, betreten flache elektrische Boote mit Platz für zwanzig Personen und gleiten lautlos über das stille Wasser. Die Route führt zwischen den von Bergleuten des 19. Jahrhunderts stehen gelassenen Felspfeilern hindurch, passiert die Überreste der Betonfundamente von Heinkel und endet an einer Aussichtsplattform, wo die Decke bis zur vollen Kathedralenhöhe ansteigt. Ein Audiokommentar auf Deutsch und Englisch zeichnet die industrielle Vergangenheit des Bergwerks, die Umwandlung während des Krieges und die langsamen geologischen Prozesse nach, die die Höhle weiterhin formen. Die Erhaltungsgebühr von achtzehn Euro pro Erwachsenem unterstützt die Instandhaltung der Beleuchtungsanlagen und Belüftungssysteme, die die Höhle stabil und für die Öffentlichkeit zugänglich halten.
Die Anlage ist montags geschlossen. Touren durch den Wienerwald mit Unterwassersee und Weinverkostung kombinieren den Besuch der Seegrotte mit Stopps in den nahegelegenen Weinbergen von Gumpoldskirchen, wo die Südhanglagen Grünen Veltliner und Zierfandler hervorbringen. Wienerwald-Touren mit Unterwassersee und Wein-Itineraren planen in der Regel neunzig Minuten für die Höhle ein, bevor es zu Kellerverkostungen weitergeht. Unabhängige Besucher, die mit dem Regionalbus vom Wiener Bahnhof Oper anreisen, sollten an der Haltestelle Hinterbrühl Markt aussteigen, die einen sechsminütigen Fußweg von der Grutschgasse entfernt liegt.
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